1971

Hijo y nieto de generales militares, a los 45 años Álvarez alcanza el grado de general.

Ese mismo año, es designado como primer jefe del Estado Mayor Conjunto (Esmaco), encargado de coordinar las operaciones internas para la represión a la guerrilla urbana de los tupamaros.

1973

Los militares toman el poder tras el golpe de Estado del 27 de junio de 1973. Álvarez se transforma en ese momento en uno de los hombres fuertes del régimen militar ocupando el puesto de secretario permanente del nuevo Consejo de Seguridad Nacional (Cosena).

1978 /1979

Entre los años 1978 y 1979, Álvarez ocupa el cargo de comandante en jefe del Ejército, en ese puesto emite la polémica orden 7777, en la que se responsabiliza de eventuales violaciones a los derechos humanos contra detenidos políticos en la dictadura.

1981

El 1° de septiembre de 1981, luego del plebiscito de 1980, donde la mayoría de los uruguayos rechazó la reforma constitucional propuesta por los militares, Álvarez, ya retirado de la actividad militar, asume como presidente de facto, en sustitución de Aparicio Méndez.

1985

El 12 de febrero abandona el mandato y entrega el gobierno al presidente de la Suprema Corte de Justicia, Rafael Addiego. Dos semanas después asume la presidencia de la República Julio María Sanguinetti, el primer presidente electo democráticamente tras el golpe de Estado de 1973. Vienen la ley de amnistía y la ley de caducidad.

2006

En mayo firma junto a otros nueve comandantes del Ejército una carta dirigida a los poderes del Estado y a la opinión pública en la que asumen la responsabilidad por los "actos de servicio cumplidos en el marco de la lucha antisubversiva". Álvarez aclara que no se trata de un "mea culpa" y dice que "es preferible caer de espaldas a caer de rodillas".

2007

12 de Noviembre

La fiscal Mirtha Guianze solicita el procesamiento del ex dictador y de los oficiales retirados de la Armada Juan Carlos Larcebau y Jorge Tróccoli como "coautores de reiterados delitos de desaparición forzada", en la causa que investiga los traslados clandestinos de presos políticos que luego habrían sido ejecutados en la dictadura.

2007 - 6 de diciembre

"A los 82 años voy a morir en la Cárcel", dice Álvarez en una entrevista publicada por el semanario Búsqueda.

Anuncia que desde la prisión hablará "de todos los temas" y sobre "la verdad histórica" y asegura que asume el juicio en su contra "con gran tranquilidad de conciencia". También rechaza responsabilidad por los traslados clandestinos.

2007 - 17 de diciembre

La Justicia procesa con prisión a Álvarez por reiterados delitos de desaparición forzada. El dictamen del juez Luis Charles, señala que tiene responsabilidad en el traslado en 1978 de una veintena de presos políticos secuestrados en los centros clandestinos de detención argentinos. Es trasladado a la cárcel de Domingo Arenas.