Torneo Clausura

Daniel Carreño llegó a Nacional para el Torneo Clausura 2006/2007. En ese certamen los tricolores terminaron duodécimos en la tabla de posiciones. Jugaron 15 partidos; ganaron 5; empataron 3 y perdieron 7. Sólo lograron 18 puntos de los 45 que disputaron y marcaron 14 goles, mientras recibieron 22.

Clásico Clausura

En el partido clásico disputado en la decimotercera fecha del Torneo Clausura el equipo de Carreño fue goleado por Peñarol 3-0. En ese encuentro los goles fueron anotados por el brasileño Silvio Mendes, en dos oportunidades, y hubo un gol en contra del ex capitán, Marco "Palillo" Vanzini.

Liguilla

El equipo tricolor ganó la Liguilla 2007 y clasificó para la próxima Copa Libertadores de América. Es este torneo Nacional logró cuatro victorias; no empató y perdió solo un partido: ante Danubio por 2-1. Logró 12 puntos de los 15 que disputó, marcó 10 goles y recibió cinco. Fue la única copa que levantó.

Clásico Liguilla

En la cuarta fecha de la Liguilla 2007 el Nacional de Daniel Carreño enfrentó a Peñarol. Esa fue la única vez que los tricolores vencieron a su tradicional rival durante su segundo mandato. El partido terminó con victoria 1-0 y en esa ocasión el gol fue anotado por Gonzalo "Chori" Castro. Fue expulsado Silvio Mendes.